DNAberfungsi sebagai pembawa informasi genetik, yakni sifat-sifat yang harus di wariskan kepada keturunannya. 7. RNA asam ribonukleat (ribonucleic acid, disingkat RNA) merupakan persenyawaan hasil transkripsi DNA. jadi bagian tertentu DNA melakukan transkripsi (mengkopi dir) membentuk .RNA. Pengertian Sintesis Protein Protein adalah suatu polipeptida yang terdiri dari rantai panjang asam amino yang merupakan hasil dari sintesis kode berupa informasi genetik dari DNA. Protein di dalam tubuh terbentuk melalui mekanisme yang disebut dengan sintesis protein. Sintesis protein adalah proses pembentukkan protein yang melibatkan DNA sebagai sumber materi genetik pengkode berbagai asam amino yang akan diolah menjadi rantai polipeptida. DNA merupakan sumber materi genetik yang terdapat di dalam nukleus, namun untuk melakukan proses sintesis proteinnya dilakukan di ribosom, untuk itu diperlukan perantara, yaitu RNA agar sintesis protein dapat berlangsung. Sintesis protein dikenal dengan istilah Dogma Sentral, yaitu rangkaian proses molekul DNA menjadi RNA, kemudian RNA menjadi protein. Sebelum masuk kedalam tahapan sintesis protein, akan dibahas terlebih dahulu mengenai struktur DNA dan RNA yang merupakan sumber materi genetik yang berperan dalam mengkode informasi untuk melakukan sintesis protein. Perbedaan Struktur DNA dengan RNA Struktur DNA Struktur RNA Kumpulan molekul nukelotida yang mengandung informasi genetik Berperan dalam penyimpan dan penyalur informasi genetik Terusun dari gula deoksiribosa, gugus fosfat dan basa nitrogen Tersusun dari gula ribosa, gugus fosfat dan basa nitrogen Terdiri dari dua untaian rantai nukleotida Hanya memiliki satu untaian rantai nukleotida Memiliki basa purin, yaitu Adenin A dan Guanin G serta basa pirimidin, yaitu Sitosin C dan Timin T RNA memiliki basa purin, yaitu Adenin A dan Guanin G serta basa pirimidin, yaitu Sitosin C, dan Urasil U Replikasi DNA Replikasi DNA adalah proses penggandaan DNA baru dari untaian DNA yang telah ada sebelumnya. Kode genetik kodon pada DNA yang dibawa dan dicetak akan membentuk RNA sebagai sumber informasi genetik untuk memulai sintesis protein. Proses atau tahapan replikasi DNA, yaitu Ikatan hidrogen DNA kromosomal diputus oleh enzim helikase dari arah 3’ ke 5’. DNA polymerase kemudian mulai membentuk salinan DNA baru dari titik P promotor ke T terminator. Leading strands adalah rantai berarah 3’ ke 5’ dimana replikasi DNA terus berjalan atau tidak terputus. Sedangkan, Lagging strands adalah rantai berarah 5’ ke 3’ dimana replikasi DNA terputus. Rantai yang mengalami lagging strands menghasilkan fragmen yang terputus-putus. Fragmen ini disebut dengan fragmen okazaki. Fragmen okazaki kemudian diperbaiki oleh enzim ligase untuk membentuk DNA baru. Maka terbentuklah DNA baru hasil replikasi dari DNA kromosomal Replikasi DNASumber Gambar Campbell, Neil A, & Reece, Jane B. 2008 Tahapan Sintesis Protein Proses sintesis protein dimulai ketika ikatan hidrogen DNA hasil replikasi dipecah atau diputus oleh enzim RNA polymerase. Kemudian rantai DNA tersebut dikode oleh mRNA. Sintesis protein terjadi melalui dua tahap, yaitu transkripsi yang dilanjutkan dengan translasi. Tahapan Sintesis ProteinSumber Gambar Campbell, N. 2005 A. Transkripsi Transkripsi adalah proses penyalinan informasi DNA kepada mRNA. Proses ini terjadi di dalam nukleus dan dikatalisasi oleh enzim RNA polymerase. Transkripsi hanya terjadi pada satu untai rantai DNA yang mengandung kelompok gen tertentu saja. Terdapat beberapa tahapan pada proses transkripsi, yaitu Tahapan TranskripsiSumber Gambar Purnomo, Sudjno, Trijoko, & S Hadisusanti. 2009 Inisiasi Permulaan Transkripsi Tahapan inisiasi, yaitu sebagai berikut RNA polymerase melekat pada daerah promoter atau pangkal transkripsi untuk memulai transkripsi. RNA polymerase kemudian berikatan dengan kumpulan protein sehingga membentuk kompleks inisiasi transkripsi. RNA polymerase membuka untaian rantai ganda DNA. Elongasi Pemanjangan Transkripsi Tahapan elongasi, yaitu sebagai berikut Setelah rantai ganda DNA terbuka, RNA polymerase kemudian meyusun untaian nukleotida-nukleotida RNA dari arah 5’ ke 3’ sesuai dengan pasangan basa nitrogennya sehingga terjadi pemanjangan RNA. RNA akan membentuk pasangan basa Adenin A dengan Urasil U. Terminasi Pengakhiran Transkripsi Tahapan terminasi, yaitu sebagai berikut Terminasi terjadi pada daerah terminator. Daerah ini memiliki urutan DNA yang berfungsi untuk menghentikan proses transkripsi. Rantai DNA menyatu kembali kemudian RNA polymerase dan mRNA yang telah terbentuk akan terlepas dari DNA. mRNA Messenger RNA, merupakan RNA yang mengandung kode genetik kodon hasil transkripsi basa nitrogen pada DNA yang menjadi cetakan untuk menjadi urutan asam amino polipeptida yang mengkode suatu protein tertentu. Kemudian mRNA akan keluar dari inti sel melalui pori-pori nukleus dan masuk ke dalam sitosol. B. Translasi Translasi adalah sintesis polipeptida dari mRNA untuk menentukan urutan-urutan asam amino yang akan membentuk suatu protein. Translasi terjadi di ribosom. Pada tahap ini, sel harus menerjemahkan kode gentik atau kodon. Kodon adalah tiga nukleotida pada urutan mRNA yang dapat diterjemahkan menjadi urutan asam amino. Urutan asam amino akan mengkode suatu protein spesifik. Terdapat beberapa tahapan pada proses translasi, yaitu Inisiasi Permulaan Translasi Ujung mRNA yang telah keluar dari nukleus akan berikatan dengan ribosom unit kecil melalui bantuan GTP dan enzim. Peristiwa tersebut disebut dengan kodon inisiasi Kodon inisiasi tersebut adalah AUG. Kodon AUG memberikan sinyal untuk memulai proses translasi. Kemudian, tRNA transfer RNA antikodon UAC yang membawa asam amino metionin melekat pada kodon inisiasi AUG. tRNA antikodon UAC merupakan komplementer dari kodon AUG. tRNA sendiri berfungsi untuk mengantarkan informasi genetik mRNA dari sitoplasma menuju ribosom untuk disusun menjadi protein. Inisiasi TranslasiSumber Gambar Campbell, N. 2005 Elongasi Pemanjangan Translasi Kodon yang dibawa oleh mRNA akan diterjemahkan satu persatu menjadi asam amino. asam amino berikutnya akan ditambahkan satu persatu-satu dari asam amino pertama metionin. Asam amino pertama metionin segera lepas dari ribosom, tRNA kembali ke sitoplasma untuk mengulangi fungsinya. tRNA berikutnya datang untuk berpasangan dengan kodon mRNA berikutnya. Setelah itu masing-masing asam amino akan digabungkan oleh tRNA. Gabungan asam amino tersebut akan membentuk rantai polipeptida yang dikatalisasi oleh rRNA. rRNA ribosomal RNA terdapat pada ribosom sub unit besar yang berfungsi sebagai enzim pembentuk ikatan peptida yang menyambungkan polipeptida-polipeptida antar asam amino. Elongasi TranslasiSumber Gambar Campbell, Neil A, & Reece, Jane B. 2008 Terminasi Pengakhiran Translasi Proses translasi berakhir ketika salah satu kodon stop mRNA UAA, UAG, dan UGA melekat pada ribosom. Polipeptida atau protein yang terbentuk akan terlepas dari ribosom dan terjadi pelepasan sub unit ribosom menjadi sub unit besar dan kecil. Protein yang telah disintesis mengalami proses post-translasi. Pada tahap ini, protein dapat berikatan dengan karbohidrat atau dipecah kembali menjadi beberapa polipeptida. Terminasi TranslasiSumber Gambar Campbell, Neil A, & Reece, Jane B. 2008 Daftar Pustaka Campbell, N. 2005. Biology. Ninth Edition. California The Benjamin/Cimmings Publishing Company, Inc. Campbell, Neil A, & Reece, Jane B. 2008. Biologi Jilid 1 Ed. 8. Jakarta Erlangga. Mader, 1998. Biology. 6th Edition. New York The McGraw-Hill Companies. Raven & Johnson. 1996. Biology. Fourth Edition. New York WBC/McGraw-Hill Companies, Inc. Purnomo, Sudjno, Trijoko, & S Hadisusanti. 2009. Biologi Kelas XI untuk SMA dan MA. Jakarta Pusat Perbukuan, Departemen Pendidikan Nasional Kontributor Dinda Muthi Selina, Alumni Biologi FMIPA UI Saattranskripsi berlangsung terjadi pemindahan informasi genetic dari DNA ke RNA. Transkripsi terjadi dengan bantuan enzim polymerase. Proses transkripsi, sesuai namanya merupakan proses pencetakan atau penulisan ulang atau menyalin ulang DNA ke dalam mRNA. Proses ini terjadi di dalam nukleus. Pada tahap ini, setiap basa nitrogen DNA dikodekan ke dalam basa nitrogen RNA. Dalam genetika, transkripsi bahasa Inggris transcription adalah pembuatan RNA terutama mRNA dengan menyalin sebagian berkas Deoxyribonucleic acid oleh enzim RNA polimerase.[i] Proses transkripsi menghasilkan mRNA dari Deoxyribonucleic acid di dalam sel yang menjadi langkah awal sintesis protein.[2] Transkripsi merupakan bagian dari rangkaian ekspresi genetik. Pengertian asli “transkripsi” adalah alih aksara atau penyalinan. Di sini, yang dimaksud adalah mengubah “teks” DNA menjadi RNA. Sebenarnya, yang berubah hanyalah basa nitrogen timina di Dna yang pada RNA digantikan oleh urasil. Proses [sunting sunting sumber] Diagram sederhana dari proses sintesis mRNA. Enzim tidak ditampilkan. Transkripsi berlangsung di dalam inti sel atau di dalam matriks mitokondria dan plastida. Transkripsi dapat dipicu oleh rangsangan dari luar maupun tanpa rangsangan. Pada proses tanpa rangsangan, transkripsi berlangsung terus-menerus gen-gennya disebut gen konstitutif atau “gen pengurus rumah”, house-keeping genes. Sementara itu, gen yang memerlukan rangsangan biasanya gen yang hanya diproduksi sewaktu-waktu; gennya disebut gen regulatorik karena biasanya mengatur mekanisme khusus. Rangsangan akan mengaktifkan bagian promoter inti,[3] segmen gen yang berfungsi sebagai pencerap RNA polimerase[4] yang terletak di bagian hulu bagian yang akan disalin disebut transcription unit, tidak jauh dari ujung 5′ gen.[4] Promoter inti terdiri dari kotak TATA, kotak CCAAT dan kotak GC.[5] Sebelum RNA polimerase dapat terikat pada promoter inti, faktor transkripsi TFIID akan membentuk kompleks dengan kotak TATA.[half dozen] Inhibitor dapat mengikat pada kompleks TFIID-TATA dan mencegah terjadinya kompleks dengan faktor transkripsi lain, namun hal ini dapat dicegah dengan TFIIA yang membentuk kompleks DA-TATA. Setelah itu TFIIB dan TFIIF akan turut terikat membentuk kompleks DABF-TATA. Setelah itu RNA polimerase akan mengikat pada DABF-TATA, dan disusul dengan TFIIE, TFIIH dan TFIIJ. Kompleks tersebut terjadi pada bagian kotak TATA yang terletak sekitar 10-25 pasangan basa di bagian hulu upstream dari kodon mulai AUG. Adanya faktor transkripsi ini akan menarik enzim RNA polimerase mendekat ke Dna dan kemudian menempatkan diri pada tempat yang sesuai dengan kodon mulai TAC pada berkas DNA. Berkas DNA yang ditempel oleh RNA polimerase disebut sebagai berkas templat, sementara berkas pasangannya disebut sebagai berkas kode karena memiliki urutan basa yang sama dengan RNA yang dibuat. Pada awal transkripsi, enzim guaniltransferase menambahkan gugus m7Gppp pada ujung 5′ untai pre-mRNA.[7] Sejumlah ATP diperlukan untuk membuat RNA polimerase mulai bergerak dari ujung iii’ ujung karboksil berkas templat ke arah ujung five’ ujung amino. pre-mRNA yang terbentuk dengan demikian berarah 5′ → 3′. Pergerakan RNA polimerase akan berhenti apabila ia menemui urutan basa yang sesuai dengan kodon berhenti, dan deret AAUAAA akan ditambahkan pada pangkal 3′ pre-mRNA.[seven] Setelah proses selesai, RNA polimerase akan lepas dari DNA, sedangkan pre-mRNA akan teriris sekitar twenty bp dari deret AAUAAA dan sebuah enzim, poliA polimerase akan menambahkan deret antara 150 – 200 adenosina untuk membentuk pre-mRNA yang lengkap yang disebut mRNA primer.[7] Tergantung intensitasnya, dalam satu berkas transcription unit of measurement sejumlah RNA polimerase dapat bekerja secara simultan. Intensitas transkripsi ditentukan oleh keadaan di sejumlah bagian tertentu pada DNA. Ada bagian yang disebut suppressor yang menekan intensitas, dan ada yang disebut enhancer yang memperkuatnya. Hasil [sunting sunting sumber] Hasil transkripsi yaitu berkas RNA yang masih “mentah” yang disebut mRNA primer.[8] Di dalamnya terdapat fragmen berkas untuk poly peptide yang mengatur dan membantu sintesis protein translasi selain fragmen untuk dilanjutkan dalam translasi sendiri, ditambah dengan bagian yang nantinya akan dipotong intron. Berkas RNA ini selanjutnya akan mengalami proses yang disebut sebagai proses pascatranskripsi post-transcriptional procedure. Langkah utama [sunting sunting sumber] Transkripsi dibagi menjadi inisiasi, pelepasan promotor, perpanjangan, dan penghentian.[nine] Inisiasi [sunting sunting sumber] Transkripsi dimulai dengan pengikatan RNA polimerase, bersama dengan satu atau lebih faktor transkripsi umum, ke urutan DNA spesifik yang disebut sebagai “promotor” untuk membentuk “kompleks tertutup” RNA polimerase-promotor. Dalam “kompleks tertutup”, DNA promotor masih sepenuhnya beruntai ganda.[10] Perpanjangan elongasi [sunting sunting sumber] Satu untai Deoxyribonucleic acid, untai cetakan atau untai non-penyandi, digunakan sebagai cetakan untuk sintesis RNA. Saat transkripsi berlangsung, RNA polimerase melintasi untai cetakan dan menggunakan komplementaritas pasangan basa dengan cetakan DNA membentuk salinan RNA yang memanjang selama traversal. Meskipun RNA polimerase melintasi untai cetakan dari iii’ → 5′, untai pengkode non-templat dan RNA yang baru terbentuk juga dapat digunakan sebagai titik referensi, sehingga transkripsi dapat digambarkan terjadi five’ → iii’. Ini menghasilkan molekul RNA dari v’ → 3′, salinan persis dari untai pengkode kecuali timin diganti dengan urasil, dan nukleotida terdiri dari gula ribosa v-karbon.[11] [12] Diagram sederhana dari perpanjangan transkripsi. Penghentian terminasi [sunting sunting sumber] Bakteri menggunakan dua strategi berbeda untuk terminasi transkripsi – terminasi tidak tergantung Rho dan terminasi tergantung Rho. Dalam penghentian tidak tergantung Rho, transkripsi RNA berhenti ketika molekul RNA yang baru disintesis membentuk loop jepit rambut kaya Thousand-C diikuti dengan lepasnya U. Ketika jepit rambut terbentuk, tekanan mekanis memutuskan ikatan rU-dA yang lemah, mengisi hibrid DNA-RNA. Hal ini menarik transkrip poli-U keluar dari situs aktif RNA polimerase, dan mengakhiri transkripsi. Dalam terminasi tergantung Rho, faktor protein yang disebut “Rho” mengacaukan interaksi antara cetakan dan mRNA, sehingga melepaskan mRNA yang baru disintesis dari kompleks elongasi.[xiii] Terminasi transkripsi pada eukariot kurang dipahami dengan baik dibandingkan pada bakteri, tetapi melibatkan pembelahan transkrip baru diikuti dengan penambahan adenin tidak tergantung cetakan pada ujung iii’ yang baru, dalam proses yang disebut poliadenilasi. Transkripsi terbalik [sunting sunting sumber] Skema dari transkripsi terbalik. Beberapa virus seperti HIV, penyebab AIDS, memiliki kemampuan untuk mentranskripsi RNA menjadi Dna. HIV memiliki genom RNA yang ditranskripsi terbalik menjadi Dna. Dna yang dihasilkan dapat digabungkan dengan genom DNA sel inang. Enzim utama yang bertanggung jawab untuk sintesis DNA dari cetakan RNA disebut reverse transkriptase. Dalam kasus HIV, opposite transkriptase bertanggung jawab untuk mensintesis untai DNA komplementer cDNA pada genom RNA virus. Enzim ribonuklease H kemudian memotong untai RNA, dan reverse transkriptase mensintesis untai komplementer Dna untuk membentuk struktur Dna heliks ganda “cDNA”. cDNA diintegrasikan ke dalam genom sel inang oleh enzim integrase, yang menyebabkan sel inang menghasilkan protein virus yang berkumpul kembali menjadi partikel virus baru. Kemudian, sel inang yaitu limfosit T mengalami kematian sel terprogram apoptosis.[14] Namun, pada retrovirus lain, sel inang tetap utuh saat virus keluar dari sel. Beberapa sel eukariotik mengandung enzim dengan aktivitas transkripsi terbalik yang disebut telomerase. Telomerase adalah reverse transkriptase yang memperpanjang ujung kromosom linier. Telomerase membawa cetakan RNA dari mana ia mensintesis urutan berulang Deoxyribonucleic acid, atau Dna “sampah”. Urutan Deoxyribonucleic acid yang berulang ini disebut telomer dan dapat dianggap sebagai “tutup” untuk kromosom. Ini penting karena setiap kali kromosom linier digandakan, itu dipersingkat. Dengan Dna “junk” atau “tutup” di ujung kromosom, pemendekan menghilangkan beberapa urutan berulang yang tidak esensial daripada urutan DNA penyandi protein, yang lebih jauh dari ujung kromosom. Telomerase sering diaktifkan dalam sel kanker untuk memungkinkan sel kanker menduplikasi genom mereka tanpa kehilangan urutan Deoxyribonucleic acid pengkode poly peptide yang penting. Aktivasi telomerase bisa menjadi bagian dari proses yang memungkinkan sel kanker menjadi abadi. Faktor keabadian kanker melalui pemanjangan telomer karena telomerase telah terbukti terjadi pada 90% dari semua tumor karsinogenik in vivo dengan x% sisanya menggunakan rute pemeliharaan telomer alternatif yang disebut pemanjangan alternatif telomer culling lengthening of telomeres, ALT.[15] Inhibitor [sunting sunting sumber] Inhibitor transkripsi dapat digunakan sebagai antibiotik terhadap patogen, misal bakteri antibakteri dan jamur antijamur. Contoh antibakteri tersebut adalah rifampisin, yang menghambat transkripsi Dna bakteri dengan menghambat RNA polimerase tergantung DNA dengan mengikat subunit beta-nya, sedangkan eight-hidroksikuinolin adalah penghambat transkripsi antijamur.[sixteen] [17] Efek metilasi histon juga dapat bekerja untuk menghambat transkripsi. Produk alami bioaktif yang kuat seperti triptolide yang menghambat transkripsi mamalia melalui penghambatan subunit XPB dari faktor transkripsi umum TFIIH baru-baru ini dilaporkan sebagai konjugat glukosa untuk menargetkan sel kanker hipoksia dengan peningkatan ekspresi transporter glukosa.[18] Inhibitor endogen [sunting sunting sumber] Pada vertebrata, sebagian besar promotor gen mengandung pulau CpG dengan banyak situs CpG.[xix] Ketika banyak situs CpG promotor gen termetilasi, gen menjadi terhambat dibungkam.[20] Kanker kolorektal biasanya memiliki three hingga 6 mutasi pengemudi dan 33 hingga 66 mutasi genetik hitchhiking atau penumpang.[21] Namun, penghambatan transkripsi pembungkaman mungkin lebih penting dalam menyebabkan perkembangan menjadi kanker dibandingkan kejadian mutasi. Misalnya pada kanker kolorektal, sekitar 600 hingga 800 gen dihambat secara transkripsi oleh metilasi pulau CpG.[22] [23] Penekanan transkripsional pada kanker juga dapat terjadi melalui mekanisme epigenetik lainnya, seperti perubahan ekspresi microRNA.[24] Pada kanker payudara, penekanan transkripsional BRCA1 dapat terjadi lebih sering oleh microRNA-182 yang diekspresikan secara berlebihan daripada oleh hipermetilasi promotor BRCA1.[25] Referensi [sunting sunting sumber] ^ Inggris Anthony JF Griffiths, Jeffrey H Miller, David T Suzuki, Richard C Lewontin, and William Chiliad Gelbart 2000. An Introduction to Genetic Analysis. Academy of British Columbia, University of California, Harvard University edisi ke-7. West. H. Freeman. hlm. Transcription and RNA polymerase. ISBN 0-7167-3520-2. Diakses tanggal 2010-08-17 . ^ Susilawati dan Bachtiar, N. 2018. Biologi Dasar Terintegrasi PDF. Pekanbaru Kreasi Edukasi. hlm. 153. ISBN 978-602-6879-99-8. ^ Inggris Anthony JF Griffiths, Jeffrey H Miller, David T Suzuki, Richard C Lewontin, and William M Gelbart 2000. An Introduction to Genetic Analysis. University of British Columbia, University of California, Harvard University edisi ke-7. W. H. Freeman. hlm. Transcription an overview of gene regulation in eukaryotes. ISBN 0-7167-3520-2. Diakses tanggal 2010-08-17 . ^ a b Inggris Anthony JF Griffiths, Jeffrey H Miller, David T Suzuki, Richard C Lewontin, and William M Gelbart 2000. An Introduction to Genetic Assay. University of British Columbia, Academy of California, Harvard University edisi ke-7. Due west. H. Freeman. hlm. Glossary – Promoter. ISBN 0-7167-3520-2. Diakses tanggal 2010-08-17 . ^ Inggris Anthony JF Griffiths, Jeffrey H Miller, David T Suzuki, Richard C Lewontin, and William M Gelbart 2000. An Introduction to Genetic Analysis. Academy of British Columbia, University of California, Harvard Academy edisi ke-7. Due west. H. Freeman. hlm. Figure 11-25. The promoter region in college eukaryotes. ISBN 0-7167-3520-two. Diakses tanggal 2010-08-17 . ^ Inggris Anthony JF Griffiths, Jeffrey H Miller, David T Suzuki, Richard C Lewontin, and William One thousand Gelbart 2000. An Introduction to Genetic Assay. Academy of British Columbia, Academy of California, Harvard University edisi ke-7. W. H. Freeman. hlm. Figure 11-29. Assembly of the RNA polymerase 2 initiation complex. ISBN 0-7167-3520-2. Diakses tanggal 2010-08-17 . ^ a b c Inggris Anthony JF Griffiths, Jeffrey H Miller, David T Suzuki, Richard C Lewontin, and William One thousand Gelbart 2000. An Introduction to Genetic Analysis. University of British Columbia, University of California, Harvard Academy edisi ke-7. W. H. Freeman. hlm. Figure 10-fifteen. Processing of principal transcript. ISBN 0-7167-3520-2. Diakses tanggal 2010-08-17 . ^ Inggris Anthony JF Griffiths, Jeffrey H Miller, David T Suzuki, Richard C Lewontin, and William M Gelbart 2000. An Introduction to Genetic Assay. University of British Columbia, University of California, Harvard University edisi ke-7. W. H. Freeman. hlm. Eukaryotic RNA. ISBN 0-7167-3520-two. Diakses tanggal 2010-08-17 . ^ Watson JD, Baker TA, Bell SP, Gann AA, Levine M, Losick RM 2013. Molecular Biology of the Gene edisi ke-7th. Pearson. ^ Henderson, Kate L.; Felth, Lindsey C.; Molzahn, Cristen M.; Shkel, Irina; Wang, Si; Chhabra, Munish; Ruff, Emily F.; Bieter, Lauren; Kraft, Joseph East. 2017-04-11. “Mechanism of transcription initiation and promoter escape by E . coli RNA polymerase”. Proceedings of the National University of Sciences dalam bahasa Inggris. 114 fifteen E3032–E3040. doi ISSN 0027-8424. PMC5393250 . PMID 28348246. ^ Reines, D.; Conaway, R. C.; Conaway, J. W. 1999-06. “Mechanism and regulation of transcriptional elongation by RNA polymerase Two”. Current Opinion in Jail cell Biology. 11 iii 342–346. doi ISSN 0955-0674. PMC3371606 . PMID 10395562. ^ Imashimizu, Masahiko; Shimamoto, Nobuo; Oshima, Taku; Kashlev, Mikhail 2014. “Transcription elongation. Heterogeneous tracking of RNA polymerase and its biological implications”. Transcription. 5 1 e28285. doi ISSN 2154-1272. PMC4214235 . PMID 25764114. ^ Banerjee, Sharmistha; Chalissery, Jisha; Bandey, Irfan; Sen, Ranjan 2006-02. “Rho-dependent transcription termination more questions than answers”. Periodical of Microbiology Seoul, Korea. 44 ane 11–22. ISSN 1225-8873. PMC1838574 . PMID 16554712. ^ Cummins, N. W.; Badley, A. D. 2010-11-11. “Mechanisms of HIV-associated lymphocyte apoptosis 2010”. Cell Death & Disease. 1 e99. doi ISSN 2041-4889. PMC3032328 . PMID 21368875. ^ Cesare, Anthony J.; Reddel, Roger R. 2010-05. “Culling lengthening of telomeres models, mechanisms and implications”. Nature Reviews. Genetics. 11 5 319–330. doi ISSN 1471-0064. PMID 20351727. ^ Campbell, Elizabeth A.; Korzheva, Nataliya; Mustaev, Arkady; Murakami, Katsuhiko; Nair, Satish; Goldfarb, Alex; Darst, Seth A. 2001-03. “Structural Mechanism for Rifampicin Inhibition of Bacterial RNA Polymerase”. Cell dalam bahasa Inggris. 104 6 901–912. doi ^ Pippi, Bruna; Reginatto, Paula; Machado, Gabriella da Rosa Monte; Bergamo, Vanessa Zafaneli; Lana, Daiane Flores Dalla; Teixeira, Mario Lettieri; Franco, Lucas Lopardi; Alves, Ricardo José; Andrade, Saulo Fernandes 2017-ten-01. “Evaluation of 8-Hydroxyquinoline Derivatives as Hits for Antifungal Drug Design”. Medical Mycology. 55 7 763–773. doi ISSN 1460-2709. PMID 28159993. ^ Datan, Emmanuel; Minn, Il; Xu, Peng; He, Qing-Li; Ahn, Hye-Hyun; Yu, Biao; Pomper, Martin One thousand.; Liu, Jun O. 2020-09-25. “A Glucose-Triptolide Cohabit Selectively Targets Cancer Cells nether Hypoxia”. iScience. 23 9 101536. doi ISSN 2589-0042. PMC7509213 . ^ Saxonov, Serge; Berg, Paul; Brutlag, Douglas L. 2006-01-31. “A genome-wide analysis of CpG dinucleotides in the human genome distinguishes 2 distinct classes of promoters”. Proceedings of the National University of Sciences of the United states. 103 v 1412–1417. doi ISSN 0027-8424. PMC1345710 . PMID 16432200. ^ Bird, Adrian 2002-01-01. “Deoxyribonucleic acid methylation patterns and epigenetic memory”. Genes & Development. 16 1 6–21. doi ISSN 0890-9369. PMID 11782440. ^ Vogelstein, Bert; Papadopoulos, Nickolas; Velculescu, Victor E.; Zhou, Shibin; Diaz, Luis A.; Kinzler, Kenneth W. 2013-03-29. “Cancer genome landscapes”. Science New York, 339 6127 1546–1558. doi ISSN 1095-9203. PMC3749880 . PMID 23539594. ^ Toyota, M.; Ahuja, N.; Ohe-Toyota, M.; Herman, J. G.; Baylin, S. B.; Issa, J. P. 1999-07-20. “CpG island methylator phenotype in colorectal cancer”. Proceedings of the National University of Sciences of the Usa of America. 96 xv 8681–8686. doi ISSN 0027-8424. PMC17576 . PMID 10411935. ^ Curtin, Karen; Slattery, Martha L.; Samowitz, Wade S. 2011-04-12. “CpG island methylation in colorectal cancer past, present and futurity”. Pathology Research International. 2011 902674. doi ISSN 2042-003X. PMC3090226 . PMID 21559209. ^ Tessitore, Alessandra; Cicciarelli, Germana; Del Vecchio, Filippo; Gaggiano, Agata; Verzella, Daniela; Fischietti, Mariafausta; Vecchiotti, Davide; Capece, Daria; Zazzeroni, Francesca 2014. “MicroRNAs in the Deoxyribonucleic acid Impairment/Repair Network and Cancer”. International Periodical of Genomics. 2014 820248. doi ISSN 2314-436X. PMC3926391 . PMID 24616890. ^ Stefansson, Olafur A.; Esteller, Manel 2013-ten. “Epigenetic Modifications in Breast Cancer and Their Role in Personalized Medicine”. The American Journal of Pathology dalam bahasa Inggris. 183 iv 1052–1063. doi Lihat pula [sunting sunting sumber] Replikasi DNA Translasi bahan genetik Pranala luar [sunting sunting sumber] Animasi tentang transkripsi di youtube.
Prosessintesis protein terdapat 2 tahap, adalah: Download Gambar. Source: kumparan.com. Urutan dasar dna dalam proses transkripsi. Rna ialah hasil dari transkripsi dari suatu fragmen dna, sehingga rna sebagai polimer yang jauh lebih pendek apabila dibandingkan dengan dna. 1.) inisisasi di tahapn ini enzim rna polymerase menyalin gen yang
TRANSKRIPSI Transkripsi dari bahasa Inggris transcription adalah proses penyalinan kode-kode genetika yang ada pada urutan DNA menjadi molekul RNA. Transkripsi adalah bagian dari rangkaian ekspresi genetik yang nantinya akan muncul sebagai fenotipe. Urutan nukleotida pada salah satu untaian molekul DNA digunakan sebagai cetakan untuk sintesis molekul RNA yang komplementer. Molekul RNA yang disintesis dalam proses transkripsi pada garis besarnya dapat dibedakan menjadi 3 kelompok molekul RNA, yaitu mRNA messenger RNA, tRNAtransfer RNA, dan rRNA ribosomal RNA. Proses Transkripsi berlangsung di dalam inti sel nukleus atau di dalam matriks pada mitokondria dan plastida. Proses transkripsi adalah proses sintesa RNA dari template DNA, bedanya basa RNA adalah Urasil U sebagai gantinya timin T. Jadi bila dalam untai DNA A maka hasil transkripsinya adalah U dan bila pada DNA T, maka pada RNA menjadi A, bila pada DNA C maka hasil transkripsi pada RNA adalah G dan sebaliknya. Contoh untai DNA AAACCGGCAAAA maka untai molekul RNA hasil transkripsi adalah RNA UUUGGCCGUUUURNA adalah untai tunggal, komplementernya DNA. RNA adalah pembawa pesan DNA urutan basa pada RNA dibaca tiga-tiga disebut kodon, mendiktekan jenis asam amino yang dikode pada tahap translasi. Jadi informasi genetik ditulis sebagai kodon dan ditranslasikan ke dalam rangkaian urutan asam aminoEnzim untuk mentranskripsi DNA menjadi RNA disebut RNA polymerase. Proses transkripsi dimulai ketika enzim RNA polimerase berkontak dengan protein pada DNA yang disebut promotor. Setelah tahap transkripsi dimulai dari proses yang disebut inisiasi, yaitu ketika enzim RNA polimerase bergabung dengan tiap gen, promotor hanya mengkode untuk mentranskripsi satu untai DNA saja. Bagian yang ditranskripsi berbeda antara satu gen dengan gen lainnya. Tahap transkripsi berikutnya adalah pemanjangan RNA, RNA terpisah atau menjauh dari DNA templatenya, sehingga kedua untai DNA dapat bergabung lagi, dilanjutkan dengan tahap ketiga transkripsi adalah terminasi, yaitu ketika RNA polimerase mencapai urutan basa tertentu yang disebut terminator. Proses transkripsi menghasilkan tiga jenis RNA, yaitu yang pertama adalah RNA yang mengkode urutan asam amino, disebut RNA pembawa atau mesenger disingkat mRNA, dan dua jenis RNA, yaitu transfer RNA disingkat tRNA sebagai molekul penerjemah dan ribosom disingkat rRNA yang menyediakan diri sebagai tempat atau pabrik pembuat protein, semuanya berperanan dalam proses yang dihasilkan bukan hanya untai dari informasi genetik dari DNA, tetapi masing-masing ujungnya diperpanjang dengan untai selain berita genetik pada proses transkripsi yang diperlukan untuk proses translasi genetik ditranslasi dalam sitoplasma. Pada prokariot semua transkripsi dan translasi terjadi dalam sitoplasma. MEKANISME TRANSKRIPSI PADA PROKARYOT Transkripsi pada dasarnya adalah proses penyalinan urutan nukleotida yang terdapat pada molekul DNA. Dalam proses transkripsi, hanya salah satu untaian DNA yang disalin menjadi urutan nukleotida RNA transkip RNA. Urutan nukleotida pada transkrip RNA bersifat komplemeter dengan urutan DNA cetakan DNA template, tetapi identik dengan urutan nukleotida DNA pada untaian pengkode coding DNA strand/nontemplate strand. Hal ini dapat digambarkan dengan skema sederhana berikut ini 5’-ATG GTC CTT TAC TTG TCT GTA TTT -3’ Untaian DNA pengkode 3’-TAC CAG GAA ATG AAC AGA CAT AAA -5’ Untaian DNA cetakan Transkripsi 5’-AUG GUC CUU UAC UUG UCU GUA UUU -3’ RNA hasil transkripsi Perlu diingat bahwa pada struktur RNA tidak ada nukleotida T thymine, karena struktur T digantikan oleh U uracil. Nukleotida T dan U mempunyai cincin yang serupa yaitu cincin pirimidin, tetapi pada basa T ada gugus metil CH3 pada atom C nomor 5, sedangkan pada basa U tidak ada gugus metil. Secara umum proses transkripsi pada prokaryot berjalan serupa dengan transkripsi pada eukaryot, meskipun ada beberapa rincian proses yang berbeda antara kedua system tersebut. Pada prokaryot, transkripsi dimulai dengan penempelan RNA polimerase holoenzim pada bagian promoter suatu gen. pada awal penempelan, RNA polimerase masih belum terikat secara kuat dan struktur promoter masih dalam keadaan tertutup closed promoter complex. Selanjutnya, RNA polimerase akan terikat secara kuat dan ikatan hydrogen molekul DNA pada bagian promoter mulai terbuka membentuk struktur open promoter complex. Pada prokaryot, RNA polimerase menempel secara langsung pada DNA di daerah promoter tanpa melalui suatu ikatan dengan protein lain. Dalam proses penempelan promoter tersebut, subunit berperan dalam menemukan bagian promoter suatu gen sehingga RNA polimerase dapat menempel. Diduga, proses pengenalan suatu promoter oleh RNA polimerase diawali dengan penempelan enzim tersebut secara tidak spesifik pada molekul DNA. Selanjutnya, RNA polimerase akan mencari bagian DNA yang mempunyai struktur khas suatu promoter. Struktur khas tersebut berupa suatu kelompok ikatan hydrogen anatara kedua untaian DNA pada posisi -35 dan -10. kecepatan suatu polimerase dalam menemukan promoter diperkirakan mencapai pasangan basa per detik. Setelah RNA polimerase menempel pada promoter, subunit melepaskan diri dari struktur holoenzim. Pelepasan subunit biasanya terjadi setelah terbentuk molekul RNA sepanjang 8-9 nukleotida. RNA polimerase inti yang sudah menempel pada promoter akan tetap terikat kuat pada DNA sehingga tidak lepas. Ikatan ini sangat penting dalam proses transkripsi selesai. Inisiasi Transkripsi Tahapan proses inisiasi transkripsi meliputi 4 langkah yaitu 1 pembentukan kompleks promoter tertutup, 2 pembentukan kompleks promoter terbuka, 3 penggabungan beberapa nukleotida awal sekiatar 10 nukleotida, dan 4 perubahan konfirmasi RNA polimerase karena subunit dilepaskan dari kompleks holoenzim. Subunit tersebut selanjutnya dapat digunakan lagi dalam proses inisiasi transkripsi selanjutnya. Bagian DNA yang terbuka setelah RNA polimerase menempel biasanya terjadi pada daerah sekitar -9 sampai +3 sehingga menjadi struktur untai tunggal. Bagian DNA yang berkaitan dengan RNA polimerase membentuk suatu struktur gelembung transkripsi transcription bubble sepanjang kurang lebih 17 pasang basa. Setelah struktur promoter terbuka secara stabil, maka selanjutnya RNA polimerase melakukan proses inisiasi transkripsi dengan menggunakan urutan DNA cetakan sebagai panduannya. Dalam proses transkripsi, nukleotida RNA digabungkan sehingga membentuk transkrip RNA. Nukleotida pertama yang digabungkan hampir selalu berupa molekul purin. Kajian pada 88 promoter menunjukkan bahwa 51% molekul RNA diawali dengan basa A, 42% diawali dengan G, 5% diawali dengan C, dan 2% diawali dengan U. pada awalnya basa-basa RNA yang digabungkan membentuk ikatan hidrogen dengan basa DNA cetakan, sehingga jika urutan DNA cetakan adalah ATG, maka basa RNA yang digabungkan adalah UAC. Subunit mempunyai peranan dalam menstimulasi inisiasi transkripsi tetapi tidak mempercepat laju pertambahan untaian RNA. Proses inisiasi transkripsi merupakan prose yang menentukan laju transkrpisi. Inisiasi transkripsi dapat dihambat oleh pemberian antibiotic rifampisin, tetapi antibiotic ini tidak menghambat proses pemajangan transkrip. Penelitian yang dilakukan oleh Alfred Heil dan Walter Zilig pada tahun 1970 membuktikan bahwa subunit RNA polimerase yang menentukan kepekaan atau ketahanan terhadap antibiotik rifampisin adalah subunit β. Setelah proses inisiasi transkripsi terjadi, selanjutnya subunit terlepas dari enzim inti dan dapat digunakan oleh enzim inti RNA polimerase yang subunit tersebut pertama kali diungkapkan oleh Travers dan Burgess pada tahun 1969. Mereka menunjukan bahwa jika transkripsi berlangsung pada kekuatan ionic yang rendah, maka RNA polimerase inti tidak terlepas dari DNA cetakan pada ujung suatu gen. Hal ini menyebabkan inisiasi transkrisi berhenti. Jika ke dalam sistem tersebut dimasukkan RNA polimerase inti yang baru maka, transkripsi kemudian berjalan kembali. Keadaan ini menunjukkan bahwa RNA polimerase inti yang baru tersebut kemudian bergabung dengan subunit yang sebelumnya telah dilepaskan dari enzim RNA polimerase inti lainnya. Proses Pemanjangan Transkrip Pada bagian gelembung transkripsi, basa-basa molekul RNA membentuk hibrid dengan DNA cetakan sepanjang kurang lebih 12 nukleotida. Hibrid RNA-DNA ini bersifat sementara sebab setelah RNA polimerasenya berjalan, maka hibrid tersebut akan terlepas dan bagian DNA yang terbuka tersebut akhirnya akan menutup lagi. RNA polimerase akan berjalan membaca DNA cetakan untuk melakukan proses pemanjangan elogation untaian RNA. Laju pemanjangan maksimum molekul transkrip RNA sekitar anatara 30 samapai 60 nukleotida perdetik, meskipun laju rata-ratanya dapat lebih rendah dari nilai ini. Secara umum, berdasarkan atas nilai laju semacam ini, suatu gen yang mengkode protein akan disalin menjadi RNA dalam waktu sekitar satu menit. Meskipun demikian, laju pemanjangan transkrip dapat menjadi sangat rendah sekitar 0,1 nekleotida perdetik jika RNA polimerase melewati sisi jeda pause site yang biasanya mengandung banyak basa GC. Proses pemanjangan transkrip dapat dihambat oleh antibiotic streptoligin. Kepekaan atau ketahanan terhadap streptoligin juga ditentukan oleh subunit β pada RNA polimerase. Dalam pemanjangan transkrip, nukleotida ditambahkan secara kovalen pada ujung 3’ molekul RNA yang baru terbentuk. Nukleotida RNA yang ditambah tersebut bersifat komplementer dengan nukleotida pada untaian DNA cetakan. Sebagai contoh, jika nukleotida pada DNA cetakan adalah A, maka nukleotida RNA yang ditambahkan adalah U. Dalam proses pemanjangan transkrip ada dua hipotesis yang diajukan mengenai perubahan topologi DNA. Hipotesis pertama menyatakan bahwa enzim RNA polimerase bergerak melingkari untaian DNA sepanjang perjalananya. Dengan cara demikian maka dapat dihindari terjadinya pelintiran pada stuktur DNA, tetapi untaian RNA hasil transkripnya akan melintir sepanjang untaian DNA. Sebaliknya, hipotesis kedua menyatakan bahwa enzim RNA polimerase bergerak lurus sepanjang untaian DNA sehingga RNA yang terbentuk tidak mengalami pelintiran, tetapi untaian DNA yang ditranskripsi harus mengalami puntiran. Untaian DNA yang ada di depan RNA polymerase akan membuka sedangkan DNA yang berada di belakangnya akan memutir kembali untuk menutup. Dalam proses pemanjangan transkrip RNA, demikian juga pada proses inisiasi sintesis RNA, terjadi pembentukan ikatan fosfodiester antara nukleotida RNA yang satu dengan nukleotida berikutnya. Pembentukan ikatan fosfodiester tersebut ditentukan oleh keberadaan subunit β pada RNA polimerase. Transkripsi akan berakir pada saat RNA polimerase mencapai ujung gen yang disebut terminator. Pada bakteri E. coli ada dua macam terminator yaitu 1 terminator yang tidak tergantung pada protein rho rho-dependent terminator, dan 2 terminator yang tergantung pada protein rhorho-independent terminator. Pengakhiran Transkripsi yang Tidak Tidak Tergantung pada Faktor Rho Pengakhiran terminasi yang tidak tergantung pada rho dilakukan tanpa harus melibatkan suatu protein khusus, melainkan ditentukan oleh adanya suatu urutan nukleotida tertentu pada bagian terminator. Sinyal yang akan mengakhiri transkripsi dengan mekanisme semacam ini ditentukan oleh daerah yang mengandung banyak urutan GC yang dapat membentuk struktur batang dan lengkung stem-and-loop pada RNA dengan panjang sekitar 20 basa di sebelah hulu dari ujung 3’ –OH dan diikuti oleh rangkaian 4-8 residu uridin berurutan. Struktur batang lengkung tersebut menyebabkan RNA polimerase berhenti dan merusak bagian 5’ dari hibrid RNA-DNA. Bagian sisa hibrid RNA-DNA tersebut berupa urutan oligo rU yang tidak cukup stabil berpasangan dengan dA. Akibatnya ujung 3’ hibrid tersebut akan terlepas sehingga transkripsi berakhir. Eksperimen yang dilakukan oleh Peggy Farnham dan Terry Platt menunjukkan bahwa pengakhiran transkripsi tanpa melibatkan factor rho mempunyai 2 ciri utama, yaitu, 1 adanya rangkaian basa berulang-balik inverted repeat yang dapat membentuk lengkungan, dan 2 adanya rangkaian basa T pada untaian DNA bukan cetakan nontemplate strand sehingga membentuk pasangan basa yang lemah antara rU-dA yang menahan transkrip RNA pada untaian DNA cetakan. Pada waktu lengkungan RNA terbentuk, maka RNA polimerase berhenti dan ikatan basa yang lemah menyebabkan RNA yang baru terbentuk akan lepas. Pengakhiran Transkripsi yang Tergantung pada Faktor Rho Mekanisme pengakhiran transkripsi semacam ini memerlukan protein ρ rho. Pengakhiran transkripsi yang memerlukan faktor rho hanya terjadi pada daerah jeda yang terletak pada jarak tertentu dari promoter. Dengan demikian jika ada daerah jeda yang terletak di dekat promoter, maka daerah itu tidak dapat berfungsi sebagai daerah pengakhiran transkripsi. Terminator yang tergantung pada rho terdiri atas suatu urutan berulang-balik yang dapat membentuk lengkungan loop, tetapi tidak ada rangkaian basa T seperti pada daerah terminator yang tidak melibatkan faktor rho. Faktor rho diduga ikut teriakat pada transkip dan mengikuti pergerakan RNA polimerase sampai akhirnya RNA polimerase berhenti pada daerah terminator yaitu sesaat setelah menyintesis lengkungan RNA. Selanjutnya, faktor rho menyebabkan destabilitasasi ikatan RNA-DNA sehingga transkrip RNA terlepas dari DNA cetakan. MEKANISME TRANSKRIPSI PADA EUKARIOTIK Secara umum mekanisme pada eukariotik serupa dengan yang terjdi pada prokariotik. Proses transkripsi diawali diinisiasi oleh proses penempelan faktor-faktor transkripsi dan kompleks enzim RNA polimerase pada daerah promoter. Faktor transkripsi dibedakan menjadi dua kelompok, yaitu 1 faktor transkripsi umum, dan 2 faktor transkripsi yang khusus suatu gen. Faktor transkripsi umum mengarahkan polimerase ke promoter. Penempelan RNA polimerase pada promoter oleh faktor transkkripsi umum hanya menghasilkan transkripsi pada dasar basal level. Pengaturan transkripsi yang lebih spesifik dilakukan oleh faktor transkripsi yang khusus untuk suatu gen. Meskipun demikian, proses penempelan tersebut sangat vital bagi keberlangsungan proses transkripsi. Setelah faktor-faktor transkripsi yang umum dan polimerase menempel pada promoter, selanjutnya akan terjadi pembentukan kompleks promoter terbuka open promoter complex. Transkripsi dimulai pada titik awal transkripsi RNA initiation site, RIS yang terletak beberapa nukleotida sebelum urutan kodon awal ATG. Pada eukariotik terdapat tiga kelas gen, yaitu gen kelas I, gen kelas II, dan gen kelas III yang masing-masing dikatalisis oleh RNA polimerase dan faktor transkripsi yang berbeda. Proses transkripsi pada eukaryot Proses transkripsi secara umum Perbedaan Transkripsi Pada Prokariot Dan Transkripsi Pada Eukariot Transkripsi Pada Prokariot 1. Pada prokariot, gen terdiri atas 3 bagian utama daerah pengendali promoter; bagian struktural dan terminator. Promoter merupakan bagian gen yang berperanan dlm mengendalikan proses transkripsi dan terletak pada ujung 5’. Promoter pd prokariot juga terdiri atas operator. Bagian Struktural adalah bagian gen yang terletak disebelah hilir downstream dari promoter. Bagian inilah yg mengandung urutan DNA spesifik kode-kode genetik yg akan ditranskripsi. Terminator adalah bagian gen yg terletak disebelah hilir dari bagian struktural yg berperanan dlm pengakhiran terminasi proses transkripsi. Fungsi terminator adalah memberikan sinyal pd enzim RNA polimerase agar menghentikan proses transkripsi. Proses terminasi transkripsi pd prokariot dpt dikelompokkan menjadi 2 kelas, yaitu 1 terminasi yg ditentukan oleh urutan nukleotida tertentu rho-independent dan 2 diatur oleh suatu protein faktor rho atau disebut rho-dependent. 2. Gen pada prokariot diorganisasikan dalam struktur operon. Contoh operon lac operon yg mengendalikan kemampuan metabolisme laktosa pada bakteri Escherichia coli. Adanya sistim operon karena satu promotor mengendalikan seluruh gen struktural. 3. Saat ditranskripsi, operon lac menghasilkan satu mRNA yg membawa kode-kode genetik untuk 3 macam polipeptida yg berbeda mRNA polisistronik, artinya dalam satu transkrip dapat terkandung lebih dari satu rangkaian kodon sistron untuk polipeptida yang berbeda. Dengan demikian, masing-masing polipeptida akan ditranslasi secara independen dari satu untaian mRNA yg sama. 4. Ciri utama gen struktural pd prokariot adalah mulai dari sekuens inisiasi translasi ATG sampai kodon terakhir sebelum titik akhir translasi kodon STOP yaitu TAA/TAG/TGA akan diterjemahkan menjadi rangkaian asam amino. Jadi, jika gen struktural terdiri atas 900 nukleotida maka gen tersebut akan mengkode 300 asam amino karena satu asam amino dikode oleh tiga sekuens nukleotida yang berurutan. Jadi, pada prokariot tidak ada intron sekuens penyisip kecuali pada beberapa archaea tertentu. 5. Pada prokariot, RNA polimerase menempel secara langsung pada DNA di daerah promoter tanpa melalui suatu ikatan dengan protein lain yang membedakan dengan eukariot 6. Pada prokariot, proses transkripsi dan translasi berlangsung hampir secara serentak, artinya sebelum transkripsi selesai dilakukan, translasi sudah dpt dimulai. 7. Urutan nukleotida RNA hasil sintesis adalah urutan nukleotida komplementer dengan cetakannya. Misal urutan ATG pada DNA, maka hasil transkripsinya adalah UAC. Molekul DNA yg ditranskripsi adalah untai ganda, namun yang berperanan sebagai cetakan, hanya salah satu untaiannya 8. Tahapan transkripsi pada prokariot meliputi 1 inisiasi transkripsi terbentuk gelembung transkripsi, 2 pemanjangan 3 terminasi tergantung faktor rho dan tidak tergantung faktor rho Transkripsi pada eukariot 1. Gen eukariot dibedakan 3 kelas yaitu Gen kelas I meliputi gen-gen yg mengkode 18SrRNA, 28SrRNA dan 5,8SrRNA ditranskripsi oleh RNA polimerase I; Pada gen kelas I terdapat dua macam promoter yaitu promoter antara spacer promoter dan promoter utama. Gen kelas II meliputi semua gen yg mengkode protein dan bbrp RNA berukuran kecil yg terdpt di dlm nukleus ditranskripsi oleh RNA polimerase II; Promoter gen kelas II terdiri atas 4 elemen yaitu sekuens pemulai initiator yg terletak pd daerah inisiasi transkripsi, elemen hilir downstream yg terletak disebelah hilir dari titik awal transkripsi, kotak TATA dan suatu elemen hulu upstream Gen kelas III meliputi gen-gen yg mengkode tRNA, 5S rRNA dan bbrp RNA kecil yg ada di dlm nukleus ditranskripsi oleh RNA polimerase III. Sebagian besar gen kelas III merupakan suatu cluster dan berulang 2. Tidak dikenal adanya sistim operon karena satu promotor mengendalikan seluruh gen struktural. 3. Gen pada eukariot bersifat monosistronik artinya satu transkrip yg dihasilkan hanya mengkode satu macam produk ekspresi satu mRNA hanya membawa satu macam rangkaian kodon untuk satu macam polipeptida. 4. Pada gen struktural eukariot, keberadaan intron merupakan hal yang sering dijumpai meskipun tidak semua gen eukariot mengandung intron. 5. Mekanisme transkripsi pada eukariot pada dasarnya menyerupai mekanisme pada prokariot. Proses transkripsi diawali diinisiasi oleh proses penempelan faktor-faktor transkripsi dan kompleks enzim RNA polimerase pd daerah promoter. RNA polimerase eukariot tidak menempel secara langsung pada DNA di daerah promoter, melainkan melalui perantaraan protein-protein lain, yg disebut faktor transkripsi transcription factor = TF. TF dibedakan 2, yaitu 1 TF umum dan 2 TF yg khusus untuk suatu gen. TF umum dalam mengarahkan RNA polimerase II ke promoter adalah TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF, TFIIH, TFIIJ. 6. Pada eukariot, proses transkripsi dan translasi tidak berlangsung secara serentak. Transkripsi berlangsung di dalam nukleus , sedangkan translasi berlangsung di dlm sitoplasma ribosom. Dengan demikian, ada jeda waktu antara transkripsi dengan translasi, yg disebut sebagai fase pasca-transkripsi. Pada fase ini, terjadi proses 1. Pemotongan dan penyambungan RNA RNA-splicing; 2. Poliadenilasi penambahan gugus poli-A pada ujung 3’mRNA; 3. Penambahan tudung cap pada ujung 5’ mRNA dan 4. Penyuntingan mRNA 7. Gen eukariot mempunyai struktur berselang-seling antara sekuens yang mengkode suatu urutan spesifik ekson dan sekuens yg tidak mengkode urutan spesifik intron. Padat ahun t erakhir ini t elah dikem bangkan t ekhnik m anipulasi RNA, t erm asuk cara unt uk m enent ukan urut an RNA. Proses ini m em berikan gam baran dalam pengat uran ekspresi gen.Mengident ifikasi dan m em pelaj ari produk t ranslasi gen yang diklonkan. Dua t ehnik yang berhubungan yait u Hybrid- Release Translat ion ( HRT) dan Hybrid- Arrest Translat ion ( HART) digunakan unt uk ident - RNA adalah singkatan ribonukleat acid yang merupakan salah satu materi genetik yang terdiri dari nukleotida. Dalam tubuh manusia RNA berperan sebagai pembawa informasi genetik dan menerjemahkannya dalam sintesis berbgai macam protein. NURUL UTAMI Struktur RNA Struktur RNA NA terdiri atas basa-basa nitrogen yang terikat pada tulang pulnggung gula-fosfat membentuk satu rantai tunggal yang berpilin atau single yang berfungsi sebagai tulang pulnggung adalah ribosa yang terdiri dari lima karbon, satu okssigen, dan satu gugus hidroksil –OH. Baca juga Replikasi DNA Teori-Teori Cara Duplikasi DNA Gugus hidroksil pada RNA membuatnya tidak stabil dan rentan terhadap basa sehingga RNA tidak dapat bertahan lama. Saat dibutuhkan RNA secara spontan akan disintesis dari DNA, digunakan, didegradi, dan di daur ulang kembali. Basa nitrogen yang terikat pada gula-fosfat RNA adalah adenine, guanine, sitosin, dan urasil. Pinguino Kolb Sebuah karya seni yang menggambarkan heliks dari DNA. Macam-Macam RNA Seperti DNA, RNA juga terbagi menjadi beberapa macam, yaitu RNA transfer atau tRNA, RNA ribosom rRNA, dan pembawa pesan atau mRNA. Baca juga Bantu Pemerintah Tangani Covid-19, Prodia Siap Lakukan Pemeriksaan SARS-CoV-2 RNA rRNA RNA ribosom atau rRNA memiliki struktur yang panjang dan stabil. Dilansir dari Encyclopaedia Britannica, rRNA disebut RNA ribosom karena merupakan penyusun ribosom bersama dengan protein dalam sitoplasma membentuk ribosom, rRNA juga berfungsi sebagai pengatur dalam sintesis protein. Sebagian kecil rRNA berfungsi untuk menerjemahkan informasi yang dibawa oleh mRNA dan sebagian besar lainnya berfungsi untuk bergabung dengan asam amino untuk membentuk berbagai macam protein non esensial. Sagar Aryal Sebuah perbandingan antara DNA dan RNA. mRNA RNA pembawa pesan atau mRNA memiliki struktur yang pendek dan tidak stabil sesuai dengan kode genetik DNA yang dibawanya. Dilansir dari Microbe Notes, kode genetik disimpan mRNA dalam bentuk triplet nukleotida atau kodon. Baca juga [HOAKS] Vaksin Covid-19 Dapat Mengubah DNA Manusia Kode genetik ini kemudian digunakan untuk mengarahkan sintesis protein. Ketersedian mRNA dalam sel hanya 5% dari total keseluruhan RNA yang ada. tRNA RNA Transfer atau tRNA memiliki struktur yang paling kecil jika dibandingkan mRNA dan rRNA. Dilansir dari Microbe Notes, tRNA terdiri atas 75-95 nukleotida yang stabil karena diikat oleh ikatan hidrogen. tRNA berfungsi untuk membaca asam amino yang dibutuhkan dengan cara melekatkan diri pada mRNA, lalu mengantarnya kedalam ribosom. NURUL UTAMI Struktur tRNA Dari gambar terlihat struktur tRNA pada bagian yang melekat ke mRNA, ketiga basa C, U, dan C tersebut adalah anti kodon yang melekat pada kodon mRNA. Basa G guanin akan selalu melekat pada basa C sitosin, dan basa U urasil akan selalu melekat pada basa A adenin. Baca juga KBRI Singapura Terima Bantuan Hand Sanitizer dan RNA Test Kit dari Temasek Pelekatan kodon mRNA dan anticodon tRNA adalah proses pembacaan kode genetik asam amino yang dibutuhkan. tRNA akan mengambil asam amino dan pada bagian ujung 3’ adalah tempat melekatnya asam amino saat ditransfer ke ribosom. Dapatkan update berita pilihan dan breaking news setiap hari dari Mari bergabung di Grup Telegram " News Update", caranya klik link kemudian join. Anda harus install aplikasi Telegram terlebih dulu di ponsel.

Langkahberikutnya adalah untuk mengisi DNA Wash Buffer (500 ml) ke dalam kolom dan disentrifugasi 10.000 xg selama 1 menit kemudian Kolom itu dimasukkan ke dalam tabung microcentrifuge 1,5 ml

Pengertian Transkripsi DNAJenis Transkripsi DNAProses Transkripsi DNAKesimpulanArtikel Terkait Tahukah anda Pengertian Transkripsi DNA, Jenis dan Proses Transkripsi DNA? Kata transkripsi mempunyai sebuah makna penerjemahan informasi yang mengenai sesuatu. Pengertian Transkripsi DNA Adalah Jenis dan Proses Transkripsi DNA Jika transkripsi digabungkan dengan DNA, maka makna ini akan menjadi sebuah informasi yang mengenai berbagai hal pada DNA. Transkripsi DNA dapat dilihat dari pengertian, jenis dan prosesnya. Seperti apa sih itu transkripsi DNA? Apabila anda bertanya mengenai hal itu dan berada disini, maka anda adalah orang yang paling beruntung. Kenapa? Karena kami disini akan mengulas tentang pengertian, jenis dan proses dari transkripsi DNA. Langsung saja disimak pembahasan yang ada dibawah ini. Baca Juga Apa itu Cetakan DNA Transkripsi DNA merupakan langkah dalam dogma sentral atau sintesis protein dengan DNA untuk ditranskripsi hingga menjadi RNA, hal ini dilakukan sebelum mengkonversi ke molekul protein. Lewat ini akan berfungsi sebagai enzim ataupun hormon untuk kelangsungan hidup dalam organisme. Pada umumnya transkripsi DNA mendapatkan bantuan dari enzim RNA sehingga ini akan menjadi pembuka dari rantai DNA yang ganda dan membentuk sebuah template DNA dengan menerjemahkan. Nah proses ini akan bekerja pada nukleus sehingga dapat menghasilkan hormon, enzim dan lain sebagainya. Jenis Transkripsi DNA Sebenarnya pada transkripsi DNA terdapat 2 jenis utama, seperti transkripsi Eukariota dan juga Prokariota. Seperti apa penjelasan dari kedu jenis tersebut? Ini dia penjelasan dari kedua jenis tersebut. Transkripsi Prokariota Transkripsi Prokariota merupakan salah satu jenis yang bersel tunggal dan masih belum memiliki membran inti atau organel membran. Gen DNA yang satu ini biasanya diawali bersama promoter dan diakhiri dengan terminator. Dalam kedua gen ini dapat diartikan sebagai basa nukleotida dan bukan dari bagian RNA yang diterjemahkan. Transkripsi dari bakteri Baca Pengertian Bakteri akan berlangsung ketika enzim polimerase sudah menempel pada promoter, hal ini dapat disebut sebagai tanda dari proses transkripsi sudah siap dimulai. Untuk proses pertamanya akan diawali bersama pembuka dari rantai RNA ganda oleh enzim polimerase. Ada kemungkinan melalui proses ini akan terciptanya RNA. Transkripsi Eukariota Transkripsi Eukariota adalah sebuah organisme yang selain gagang dan juga bakteri dengan memiliki struktur pada DNA yang lengkap. Hal ini disebabkan adanya ukuran dari dalam sel yang panjang. RNA polimerase terdapat di Prokariota yang tidak mampu untuk bekerja dengan sendirinya. Akan tetapi enzim tersebut bisa dibantu oleh berbagai faktor transkripsi yang lainnya. Untuk langkah inisiasi salah satu transkripsi DNA bisa diawali dengan cara menempelnya pada transkripsi promoter. Dengan begitu promoter akan memancing RNA polimerase sehingga menempelnya dengan membentuk kompleks dari inisiasi transkripsi. Maka dari itu, rantai ganda bisa terbuka dengan bantuan dari RNA polimerase. Proses Transkripsi DNA Pada proses transkripsi DNA terdapat molekul DNA yang dapat memberikan sebuah kode perubahan dari asam nukleat hingga menjadi asam amino. Asam amino ini dapat berfungsi untuk menyusun protein dengan cara tidak melibatkan sebuah proses tersebut. Sintesis protein secara langsung akan mendapatkan dua tahap, yakni transkripsi dan juga translasi. Proses tersebut akan bertujuan untuk pembentukan dari mRNA menjadi DNA dan terjadi dalam nukleus. Akan tetapi proses ini akan melewati tiga tahap, seperti apa yang sudah kami tulis dibawah ini. Inisiasi Inisiasi menjadi sebuah proses pertama dari proses yang transkripsi DNA. Dimana proses ini dijuluki sebagai promoter dalam daerah yang menjadikan tempat dari pelekatnya RNA polimerase untuk area yang memulainya transkripsi. RNA polimerase berkaitan bersama promoter dan sebuah protein yang menjadi salah satu faktor transkripsi. Pada umumnya perkumpulan dari RNA polimerase, faktor transkripsi dan protein dapat digabungkan kedalam inisiasi transkripsi. Elongasi Elongasi adalah salah satu proses jalianan rantai DNA ganda yang terbuka. Dimana hal ini akan membuat RNA polimerase dapat menyusun berbagai untaian nukleotida. Pada proses ini akan membuat RNA bertumbuh memanjang karena adanya pasangan basa dari nitrogen DNA yang akan terbentuk. Ini terjadi karena ketiadaan basa dari purimidin timin. Dengan begitu RNA bisa membentuk pasangan dari urasil serta adenin. Sedangkan keberadaan dari tiga jenis yang lainnya, misalnya sitosin, guanin dan adenin akan berpasangan sendirinya dengan berdasarkan pada pengaturan dari komplemennya yang sendiri-sendiri. Terminasi Untuk proses yang paling terakhir dari jalannya transkripsi DNA adalah terminasi dimana sebuah untaian dari RNA bisa berakhir pada area terminator. Akhir dari sebuah proses transkripsi DNA terjadi karena adanya persatuan dari rantai. Dengan demikian RNA polimerase bisa terlepas dari transkripsi DNA, mulai pelepasan ini akan membentuk sebuah RNA baru yang mirip dengan mRNA. Pada transkripsi DNA dalam sel Prokariotik terdapat hasil dari transkripsi DNA sehingga membentuk RNA pada proses pengambilan peran yang sebagai mRNA. Proses yang menimpa mRNA akan mendapatkan beberapa urutan dari basa nitrogen yang berpasangan dalam pembacaan dan terdapat pada pesan dari genetik DNA. Dengan adanya urutan dari basa nitrogen dapat menghasilkan kodon atau triplet dalam nukleotida mRNA apabila sudah melalui proses dari transkripsi. Kesimpulan Transkripsi DNA merupakan proses penyalinan DNA untuk menjadi RNA. terdapat dua jenis Transkripsi DNA yaitu Transkripsi Prokariota dan Transkripsi Eurkariota. Proses Transkripsi DNA dimulai dengan proses inisiasi atau disebut juga promoter, dilanjutkan dengan elongasi, dan yang terakhir terminasi dimana untaian RNA berakhir di terminator. Dengan demikianlah pembahasan pada kali ini, semoga anda yang sudah membacanya dapat mendapatkan informasi yang mengenai dari transkripsi DNA. Baca Juga Perbedaan Sel Eukariotik dan Sel Prokariotik
Transkripsiadalah proses penyalinan urutan nukleotida yang terdapat pada molekul DNA. ARN yang dibentuk oleh ADN ini berupa rantai tunggal polinukleotida. Tepatnya, ARB terbentuk dari ribonukleotida yaitu ikatan antara fosfat, gula pentosa (ribosa), dan basa nitrogen.
Reaksipolimerisasi atau pemanjangan RNA sama ama replikasi DNA yaitu dengan arah 5′ -> 3′ Untai DNA yang berperan sebagai cetakan hanya salah satu untai; Hasil transkripsi berupa RNA untai tunggal; pada operon lac punya 3 gen struktural yaitu lac Z, lac Y dan lac A. Masing2 dr gen itu punya start codon dan stop codon sendiri2 namun
d. nukleus. e). retikulum endoplasma. Jawab: d. 4). Contoh Soal: Pasangan Basa Nitrogen Penyusun DNA - Deoxyribonucleic Acid. Molekul- molekul basa nitrogen yang menyusun molekul DNA selalu berpasangan. Pasangan- pasangan basa tersebut selalu tetap, yaitu. a). adenin - timin - sitosin - guanin. b). adenin - guanin - sitosin
I6xMkle.
  • 3bhya3r556.pages.dev/307
  • 3bhya3r556.pages.dev/92
  • 3bhya3r556.pages.dev/159
  • 3bhya3r556.pages.dev/259
  • 3bhya3r556.pages.dev/409
  • 3bhya3r556.pages.dev/380
  • 3bhya3r556.pages.dev/336
  • 3bhya3r556.pages.dev/493
  • hasil transkripsi dna adalah rna struktural yaitu